MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 125534

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005296	CG	3	6	765	770	0 %	0 %	50 %	50 %	39933081
2	NC_005296	ACG	2	6	791	796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933081
3	NC_005296	ACT	2	6	851	856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933081
4	NC_005296	GCC	2	6	977	982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933081
5	NC_005296	CGA	2	6	984	989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933081
6	NC_005296	CGTC	2	8	994	1001	0 %	25 %	25 %	50 %	39933081
7	NC_005296	GCA	2	6	1010	1015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933081
8	NC_005296	CGG	2	6	1053	1058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933081
9	NC_005296	CGC	2	6	1061	1066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933081
10	NC_005296	CGC	3	9	1125	1133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933081
11	NC_005296	GCC	2	6	1151	1156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933081
12	NC_005296	GCG	2	6	1157	1162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933081
13	NC_005296	CTG	2	6	1222	1227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933081
14	NC_005296	CCG	2	6	1283	1288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933081
15	NC_005296	TCG	2	6	1307	1312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933081
16	NC_005296	CTCG	2	8	1332	1339	0 %	25 %	25 %	50 %	39933081
17	NC_005296	CGA	2	6	1380	1385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933081
18	NC_005296	ACC	2	6	1408	1413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933081
19	NC_005296	GCCG	2	8	1453	1460	0 %	0 %	50 %	50 %	39933081
20	NC_005296	GTG	2	6	1465	1470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933081
21	NC_005296	CGC	2	6	1473	1478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933081
22	NC_005296	GCC	2	6	1485	1490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933081
23	NC_005296	CGA	2	6	1509	1514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933081
24	NC_005296	GGT	2	6	1537	1542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933081
25	NC_005296	CG	3	6	1598	1603	0 %	0 %	50 %	50 %	39933081
26	NC_005296	CACC	2	8	1617	1624	25 %	0 %	0 %	75 %	39933081
27	NC_005296	CTG	2	6	1717	1722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933081
28	NC_005296	CTG	2	6	1873	1878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933081
29	NC_005296	TCG	2	6	1879	1884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933081
30	NC_005296	GACGCT	2	12	1938	1949	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	39933081
31	NC_005296	GCC	2	6	1970	1975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933081
32	NC_005296	ACCAC	2	10	1991	2000	40 %	0 %	0 %	60 %	39933081
33	NC_005296	TGC	2	6	2003	2008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933081
34	NC_005296	CG	3	6	2350	2355	0 %	0 %	50 %	50 %	39933082
35	NC_005296	CGAC	2	8	2468	2475	25 %	0 %	25 %	50 %	39933082
36	NC_005296	GCCG	2	8	2502	2509	0 %	0 %	50 %	50 %	39933082
37	NC_005296	CGA	2	6	2528	2533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933082
38	NC_005296	GCCG	2	8	2635	2642	0 %	0 %	50 %	50 %	39933082
39	NC_005296	CGC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933082
40	NC_005296	GATC	2	8	2748	2755	25 %	25 %	25 %	25 %	39933082
41	NC_005296	CTA	2	6	2790	2795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933082
42	NC_005296	CCG	2	6	2819	2824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933082
43	NC_005296	GC	3	6	2847	2852	0 %	0 %	50 %	50 %	39933082
44	NC_005296	CGAC	2	8	2858	2865	25 %	0 %	25 %	50 %	39933082
45	NC_005296	GCG	2	6	2903	2908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933082
46	NC_005296	CGT	2	6	3036	3041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933082
47	NC_005296	AAC	2	6	3100	3105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933082
48	NC_005296	CTG	2	6	3115	3120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933082
49	NC_005296	AAG	2	6	3127	3132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933082
50	NC_005296	CGA	2	6	3161	3166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933082
51	NC_005296	CCG	2	6	3206	3211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933082
52	NC_005296	GAA	2	6	3259	3264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933082
53	NC_005296	GC	3	6	3416	3421	0 %	0 %	50 %	50 %	39933082
54	NC_005296	AGGCG	2	10	3449	3458	20 %	0 %	60 %	20 %	39933082
55	NC_005296	CGT	2	6	3686	3691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933083
56	NC_005296	CCG	2	6	3698	3703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933083
57	NC_005296	CTGACG	2	12	3718	3729	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	39933083
58	NC_005296	CCG	2	6	3767	3772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933083
59	NC_005296	GGT	2	6	3777	3782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933083
60	NC_005296	GCG	2	6	3858	3863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933083
61	NC_005296	GC	3	6	3932	3937	0 %	0 %	50 %	50 %	39933083
62	NC_005296	GCC	2	6	3969	3974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933083
63	NC_005296	GCG	2	6	3977	3982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933083
64	NC_005296	ACC	2	6	3985	3990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933083
65	NC_005296	ACG	2	6	3991	3996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933083
66	NC_005296	CGG	3	9	4031	4039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933083
67	NC_005296	CTG	2	6	4210	4215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933083
68	NC_005296	GCAGC	2	10	4291	4300	20 %	0 %	40 %	40 %	39933083
69	NC_005296	CGC	2	6	4323	4328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933083
70	NC_005296	TCCG	2	8	4362	4369	0 %	25 %	25 %	50 %	39933083
71	NC_005296	TGGA	2	8	4390	4397	25 %	25 %	50 %	0 %	39933083
72	NC_005296	GACGC	2	10	4469	4478	20 %	0 %	40 %	40 %	39933083
73	NC_005296	CGC	3	9	4476	4484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933083
74	NC_005296	GC	3	6	4552	4557	0 %	0 %	50 %	50 %	39933083
75	NC_005296	GCT	2	6	4584	4589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933083
76	NC_005296	TCG	2	6	4619	4624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933083
77	NC_005296	CGC	2	6	4643	4648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933083
78	NC_005296	TGC	3	9	4649	4657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933083
79	NC_005296	CGA	2	6	4659	4664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933083
80	NC_005296	GTG	2	6	4666	4671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933083
81	NC_005296	GTT	2	6	4701	4706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933083
82	NC_005296	GC	3	6	4727	4732	0 %	0 %	50 %	50 %	39933083
83	NC_005296	CG	3	6	4823	4828	0 %	0 %	50 %	50 %	39933083
84	NC_005296	GCCG	2	8	5097	5104	0 %	0 %	50 %	50 %	39933084
85	NC_005296	CGA	2	6	5184	5189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933084
86	NC_005296	CAC	2	6	5203	5208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933084
87	NC_005296	GTC	2	6	5221	5226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933084
88	NC_005296	CGA	2	6	5238	5243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933084
89	NC_005296	GGCC	2	8	5250	5257	0 %	0 %	50 %	50 %	39933084
90	NC_005296	CGA	2	6	5310	5315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933084
91	NC_005296	GT	3	6	5354	5359	0 %	50 %	50 %	0 %	39933084
92	NC_005296	CGG	2	6	5360	5365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933084
93	NC_005296	TCA	2	6	5372	5377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933084
94	NC_005296	CGG	2	6	5394	5399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933084
95	NC_005296	GGC	2	6	5431	5436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933084
96	NC_005296	CGGCGT	2	12	5442	5453	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	39933084
97	NC_005296	GGT	2	6	5457	5462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933084
98	NC_005296	TGC	2	6	5486	5491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933084
99	NC_005296	CAC	2	6	5549	5554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933084
100	NC_005296	GTC	2	6	5560	5565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933084
101	NC_005296	GCG	2	6	5759	5764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933084
102	NC_005296	CAA	2	6	5793	5798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933084
103	NC_005296	GGT	2	6	5820	5825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933084
104	NC_005296	TGG	2	6	5869	5874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933084
105	NC_005296	GTGCT	2	10	5896	5905	0 %	40 %	40 %	20 %	39933084
106	NC_005296	CAA	2	6	5910	5915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933084
107	NC_005296	CGG	2	6	5931	5936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933084
108	NC_005296	CCGCG	2	10	5955	5964	0 %	0 %	40 %	60 %	39933084
109	NC_005296	AAG	2	6	6004	6009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933084
110	NC_005296	CGA	2	6	6030	6035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933084
111	NC_005296	CCG	2	6	6053	6058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933084
112	NC_005296	CCCGA	2	10	6076	6085	20 %	0 %	20 %	60 %	39933084
113	NC_005296	TCG	2	6	6091	6096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933084
114	NC_005296	GGT	2	6	6135	6140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933084
115	NC_005296	CTGG	2	8	6171	6178	0 %	25 %	50 %	25 %	39933084
116	NC_005296	TCCG	2	8	6186	6193	0 %	25 %	25 %	50 %	39933084
117	NC_005296	GGT	2	6	6216	6221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933084
118	NC_005296	GCC	2	6	6244	6249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933084
119	NC_005296	GC	3	6	6256	6261	0 %	0 %	50 %	50 %	39933084
120	NC_005296	GC	3	6	6281	6286	0 %	0 %	50 %	50 %	39933084
121	NC_005296	TCG	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933084
122	NC_005296	GGC	2	6	6379	6384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933084
123	NC_005296	GC	5	10	6456	6465	0 %	0 %	50 %	50 %	39933084
124	NC_005296	ATC	2	6	6571	6576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933084
125	NC_005296	TGA	2	6	6578	6583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933084
126	NC_005296	CCGACG	2	12	6584	6595	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	39933084
127	NC_005296	CA	3	6	6605	6610	50 %	0 %	0 %	50 %	39933084
128	NC_005296	GCT	3	9	6618	6626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933084
129	NC_005296	TTC	3	9	6631	6639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933084
130	NC_005296	GGC	2	6	6664	6669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933084
131	NC_005296	GCC	2	6	6687	6692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933084
132	NC_005296	CG	3	6	6742	6747	0 %	0 %	50 %	50 %	39933084
133	NC_005296	CGA	2	6	6777	6782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933084
134	NC_005296	GCG	2	6	6815	6820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933084
135	NC_005296	CTG	2	6	6829	6834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933084
136	NC_005296	GC	4	8	6850	6857	0 %	0 %	50 %	50 %	39933084
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386	NC_005296	GGCT	2	8	17263	17270	0 %	25 %	50 %	25 %	39933094
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394	NC_005296	GAT	2	6	17595	17600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933095
395	NC_005296	GGCCG	2	10	17605	17614	0 %	0 %	60 %	40 %	39933095
396	NC_005296	CGA	2	6	17633	17638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933095
397	NC_005296	ATC	2	6	17644	17649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933095
398	NC_005296	CGG	2	6	17655	17660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933095
399	NC_005296	CCA	2	6	17678	17683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933095
400	NC_005296	TTG	2	6	17701	17706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933095
401	NC_005296	CAC	2	6	17828	17833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933095
402	NC_005296	CGA	2	6	17840	17845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933095
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471	NC_005296	CGA	2	6	20723	20728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933098
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485	NC_005296	GCA	2	6	21341	21346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933099
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493	NC_005296	GAA	2	6	21624	21629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933099
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495	NC_005296	GTT	2	6	21732	21737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933099
496	NC_005296	GCA	2	6	21746	21751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933099
497	NC_005296	TGA	3	9	21761	21769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933099
498	NC_005296	TCA	2	6	21818	21823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933099
499	NC_005296	CAG	2	6	21840	21845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933099
500	NC_005296	CGATGA	2	12	21944	21955	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	39933099

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